Коллекцию нута Вавилова генноанализировали

Ученые Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого в сотрудничестве с ВИР им. Н.И. Вавилова и коллегами из университетов США проанализировали 407 образцов нута из коллекции генетических ресурсов растений ВИР им. Вавилова, собранных в период с 1911 по 1940 год. Они обнаружили участки генома, содержащие однонуклеотидные полиморфизмы – замены отдельных нуклеотидов в последовательности ДНК, которые связаны с ценными селекционными признаками

Определяющей задачей XXI века является удовлетворение потребностей в питании растущего населения в условиях изменения климата, ограниченных земельных и водных ресурсов.

В генетическом банке семян ВИР им. Н.И. Вавилова хранится множество староместных сортов нута, выращиваемых в том числе в Турции, Индии, Эфиопии, Узбекистане и Марокко более ста лет назад.

Эти сорта вышли из сельскохозяйственного производства, но представляют собой определенную научную, социально-экономическую и культурно-историческую ценность. Они содержат «генетические жемчужины» – участки генома, которые могут быть источниками хозяйственно-ценных признаков, способных ускорить современные селекционные работы.

«Полученные результаты подчеркивают потенциал староместных сортов нута из коллекции ВИР им. Н.И.Вавилова. Расширение генетической базы нута должно способствовать производству новых сортов для удовлетворения меняющихся потребностей покупателей, новых методов ведения сельского хозяйства и ожидаемых изменений в климатических условиях», - комментирует Маргарита Вишнякова, соавтор статьи, доктор биологических наук, руководитель отдела генетических ресурсов зернобобовых культур ВИР.

«Интеграция данных о генетической изменчивости с фенотипическими данными и огромным количеством исторической информации, хранящейся в банке семян ВИР, выполненная нами, является ключом к интенсификации селекции нута на основе геномных технологий», - говорит Мария Самсонова, соавтор статьи, профессор, заведующая лабораторией «Математическая биология и информатика» Санкт-Петербургского Политехнического университета.

Проведенное исследование способствуют более глубокому пониманию генетической изменчивости признаков нута и расширяет возможности для интенсификации селекции на основе данных о геноме и окружающей среде.

Следующим этапом работы станет функциональное подтверждение идентифицированных генов-кандидатов для использования в селекции.

Исследование подробно описано в статье «Genomic Analysis of Vavilov’s Historic Chickpea Landraces Reveals Footprints of Environmental and Human Selection», опубликованной в журнале International Journal of Molecular Sciences

Авторами обзора являются: Alena Sokolkova, Sergey V. Bulyntsev, Peter L. Chang, Noelia Carrasquilla-Garcia, Anna A. Igolkina,1 Nina V. Noujdina, Eric von Wettberg, Margarita A. Vishnyakova, Douglas R. Cook, Sergey V. Nuzhdin and Maria G. Samsonova

DOI: 10.3390/ijms21113952

(Источник: официальный сайт ВИР. Фото предоставлено сотрудниками ВИР им Н.И. Вавилова и Санкт-Петербургского политехнического университета Петра Великого).